Методы доставки для различных групп покупателей

Возможно ли разделить доставку таким образом, чтобы разным группам покупателей показывались разные варианты доставки. Например: розничным — бесплатно в пределах МКАД при покупке на N рублей, X рублей при покупке меньше и тп. Оптовым покупателям — свои тарифы, или например вообще поставить согласование с оператором. Такое возможно?

Да, можно поставить доступность покупателю метода доставки в зависимость от объёма заказа и других факторов.
Обратите внимание на стандартные для Magento методы Free Shipping и USPS - там данная функциональность предусмотрена.
Как правило, данную бизнес-логику добавляют в метод collectRates класса-потомка Mage_Shipping_Model_Carrier_Abstract.