чем отличается папка, к примеру в adminhtml, default от той, которую мы создали

я знаю что в default находятся маджентовские файлы, в той, что мы создали, располагаются наши фалы. При установки модуля, маджента файлы этого модуля кладет в dafault и на сайте их не видно, когда их перенес в свою папку, они стали отображаться. Вопрос в том нужно ли где-нибудь прописывать пути к этим файлам и чем эти папки различаются?